Sora y sus amigos finalmente llegan a la sede de la Organización XIII para salvar Kairi. Pero ya se ha escapado de su celda, con la ayuda de Riku, físicamente irreconocible. Entonces van al encuentro de su amigo. Por su parte, Mickey y Ansem el Sabio se esfuerzan por detener la progresión de Kingdom Hearts.

Manga shonen basado en el famoso videojuego de Square Enix y ambientado en un mundo que mezcla los personajes de Disney con los de Final Fantasy.